PVE=player VS environment，即玩家对抗环境，就是玩家和游戏程序所控制的怪物和boss的对抗、挑战。往往这些PVE里对抗的都是较强的怪物和boss，《萌斗罗》里也是如此。目前PVE副本支持最多三人组队战斗，后续版本会逐渐增加人数。
玩家点击游戏大厅的“异界之门”按钮，则进入该界面。左方为副本，右方为塔防。每一关卡的图标随着上一关卡的破关而解锁，同时受到等级的限制。塔防全部关卡完成后，副本模式才会开启。
点击关卡图标，会弹出难度选择界面，玩家可以点击选择难度，可以随机加入任意房间，或是自己创建房间。房主可以邀请好友，且不管房间里是否满员，都可以开始游戏。
玩家组队挑战副本，同队最多三人。三人进入副本后，进行协同作战。
胜利规则：在死亡次数不超过一定值的情况下击败boss
失败规则：复活次数用完，仍旧没有击败boss
复活规则：队伍全灭后，扣除一次复活次数，三人全体复活，boss回到初始位置满血满蓝
换英雄规则：boss跟玩家都满血的情况下，玩家可以更换操纵的英雄
复活次数：9次
